Informasi

Basis Data Rentang Geografis Spesies

Basis Data Rentang Geografis Spesies



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Apakah ada database organisme yang berisi lokasi geografis mereka yang dapat dipertanyakan?

Saya perlu melakukan kueri yang agak sederhana, sepertiHewan dari , di mana Lokasi adalah beberapa wilayah geografis yang terdefinisi dengan baik seperti Republik Ceko atau Eropa.

Sejauh ini saya telah menemukan beberapa daftar di Wikipedia dan halaman web lain, namun tampaknya tidak lengkap karena perpotongannya cukup kecil. Selain itu, saya telah menemukan koleksi EOL (Encyclopedia of Life) tetapi mereka tampaknya berjuang dengan cara yang sama.


Ini sebagian besar merupakan pertanyaan tentang seberapa andal data dalam database perlu. Keandalan (dan skala spasial) akan berbeda antara kumpulan data dan antara kelompok spesies dalam kumpulan data, dan sulit untuk memberikan rekomendasi umum. Saya ragu Anda akan menemukan database tunggal dengan cakupan yang baik untuk semua kelompok taksonomi, bahkan jika itu dalam bentuk daftar periksa negara. Untuk informasi yang paling dapat diandalkan, daftar periksa negara yang dikuratori untuk kelompok taksonomi tertentu mungkin akan menjadi yang terbaik, tetapi ini harus dicari secara individual untuk setiap kelompok taksonomi yang diminati.

Sebagai titik awal, Anda mungkin ingin melihat data kejadian yang dapat ditemukan di gbif.org (Fasilitas Keanekaragaman Hayati Global). Data yang ditemukan di sana tentu tidak lengkap, dan akan menyesatkan banyak spesies. Namun, untuk distribusi kelompok spesies yang relatif terkenal saat ini, ini akan memberi Anda gambaran yang baik tentang distribusinya. Ini harus dievaluasi berdasarkan kasus per kasus. Anda dapat mengakses data di gbif menggunakan alat eksternal, misalnya menggunakan R melalui rgbif (ada juga alat untuk python atau bahasa lain). Di blog recology.info Anda dapat menemukan tutorial tentang cara mendapatkan daftar spesies untuk negara tertentu menggunakan rgbif (lebih khusus fungsinyakepadatan_spplist).


Basis data GBIF yang disarankan dapat memberi Anda lokasi kejadian yang diberikan pada hewan tertentu. Tapi Anda meminta daftar hewan yang diberikan beberapa lokasi. Alat yang sangat baik untuk memberikan daftar hewan yang diberikan lokasi di dunia adalah Peta Kehidupan. Klik "Species by Location" yang memberikan peta dunia, dan klik di mana saja untuk mendapatkan daftar spesies yang dapat muncul di sana.


Lokasi geografis dan filogeni adalah penentu utama ukuran jangkauan geografis kumbang air

Mengapa beberapa spesies tersebar luas sementara yang lain sangat terbatas secara geografis adalah salah satu pertanyaan paling mendasar dalam biologi, meskipun sebagian besar masih belum terjawab. Hal ini terutama terjadi pada kelompok spesies yang berkerabat dekat, yang sering menunjukkan perbedaan besar dalam ukuran rentang geografis meskipun berbagi banyak faktor lain karena pewarisan filogenetik yang sama. Kami menggunakan sepuluh garis keturunan Coleoptera akuatik dari Paleartik barat untuk menguji dalam kerangka komparatif serangkaian kemungkinan penentu ukuran kisaran: usia spesies, perbedaan toleransi ekologis, kemampuan penyebaran, dan lokasi geografis.

Hasil

Ketika semua faktor digabungkan dalam model regresi berganda antara 60-98% varians dijelaskan oleh lokasi geografis dan sinyal filogenetik. Batas garis lintang dan garis bujur maksimum berkorelasi positif dengan ukuran kisaran, dengan spesies di garis lintang paling utara dan garis bujur timur menunjukkan kisaran terbesar. Dalam garis keturunan dengan spesies lotik dan lentik, lentik (penyebar yang lebih baik) menunjukkan rentang distribusi yang lebih besar daripada spesies lotik (penyebar yang lebih buruk). Ukuran kisaran geografis juga berkorelasi positif dengan luasnya bioma di mana spesies tersebut ditemukan, tetapi kami tidak menemukan bukti hubungan yang jelas antara ukuran kisaran dan usia spesies.

Kesimpulan

Temuan kami menunjukkan bahwa ukuran kisaran suatu spesies dibentuk oleh interaksi faktor geografis dan ekologis, dengan komponen filogenetik yang mempengaruhi keduanya. Pemahaman tentang faktor-faktor yang menentukan ukuran dan lokasi geografis dari kisaran distribusi spesies sangat penting untuk mempelajari asal usul dan kumpulan biota saat ini. Hasil kami menunjukkan bahwa untuk tujuan ini data yang paling relevan mungkin adalah sejarah filogenetik spesies dan lokasi geografisnya.


Apa yang menentukan rentang geografis suatu spesies? Biologi termal dan hubungan ukuran rentang latitudinal pada kumbang penyelam Eropa (Coleoptera: Dytiscidae)

1. Ukuran jangkauan geografis spesies individu sangat bervariasi, meskipun faktor-faktor yang mendasari variasi ini masih kurang dipahami, dan dapat mencakup sejumlah proses ekologi dan evolusi. Penjelasan yang disukai untuk variasi ukuran rentang adalah bahwa ini hasil dari perbedaan dalam luas relung mendasar, menunjukkan peran kunci fisiologi dalam menentukan ukuran rentang, meskipun sampai saat ini tes empiris dari ide-ide ini tetap terbatas.

2. Di sini kami mengeksplorasi hubungan antara fisiologi termal dan biogeografi, sambil mengendalikan kemungkinan perbedaan dalam kemampuan penyebaran dan keterkaitan filogenetik, di 14 congener yang serupa secara ekologis yang berbeda dalam jangkauan geografis, kumbang penyelam Eropa dari genus Deronectes Tajam (Coleoptera, Dytiscidae). Toleransi suhu atas dan bawah mutlak dan kemampuan aklimatisasi ditentukan untuk populasi setiap spesies, mengikuti aklimasi di laboratorium.

3. Rentang toleransi termal absolut adalah prediktor terbaik dari luas dan posisi rentang latitudinal kedua spesies, perbedaan dalam kemampuan penyebaran (berdasarkan ukuran sayap) tampaknya kurang penting dalam kelompok ini. Selain itu, batas kisaran utara dan selatan spesies terkait dengan toleransi mereka terhadap suhu rendah dan tinggi. Dalam semua kasus, toleransi suhu absolut, daripada kemampuan aklimatisasi adalah prediktor terbaik dari parameter jangkauan, sementara penggunaan kontras independen menunjukkan bahwa kemampuan aklimatisasi termal spesies mungkin juga berhubungan dengan biogeografi, meskipun peningkatan kemampuan aklimatisasi tampaknya tidak terkait dengan peningkatan ukuran jangkauan.

4. Studi kami adalah yang pertama memberikan dukungan empiris untuk hubungan antara fisiologi termal dan variasi ukuran kisaran pada spesies yang tersebar luas dan terbatas, dilakukan menggunakan desain eksperimental yang sama, dalam kerangka kerja yang dikendalikan secara filogenetik dan ekologis.

Lampiran S1. Lokalitas koleksi, batas rentang selatan dan utara, luasan rentang latitudinal (LRE) dan titik pusat rentang latitudinal (LRCP) untuk Deronectes spesies dipelajari.

Lampiran S2. Massa tubuh, ukuran sayap, dan kinerja termal Deronectes jenis.

Harap diperhatikan: Sebagai layanan kepada penulis dan pembaca kami, jurnal ini menyediakan informasi pendukung yang diberikan oleh penulis. Materi tersebut dapat diatur ulang untuk pengiriman online, tetapi tidak disalin atau diketik. Masalah dukungan teknis yang timbul dari informasi pendukung (selain file yang hilang) harus ditujukan kepada penulis.

Nama file Keterangan
JANE_1611_sm_Lampiran 2.doc30 KB Item info pendukung
JANE_1611_sm_Lampiran 1.doc28 KB Item info pendukung

Harap diperhatikan: Penerbit tidak bertanggung jawab atas konten atau fungsi dari informasi pendukung apa pun yang diberikan oleh penulis. Setiap pertanyaan (selain konten yang hilang) harus diarahkan ke penulis yang sesuai untuk artikel tersebut.


Bahan dan metode

Pengumpulan, pemeliharaan, dan persiapan spesimen

Dewasa Deronectes dikumpulkan selama musim semi dan musim panas 2006 (lihat Lampiran S1, Informasi Pendukung) menstandarisasi sebanyak mungkin untuk musim pengumpulan, mengerjakan jaring kolam berbingkai D (mata jaring 1 mm, dimensi 20 × 25 cm) di sepanjang tepi sungai. Kami mempelajari orang dewasa karena ini adalah tahap riwayat hidup dengan durasi terlama (≥1 tahun), mudah dikumpulkan dari lapangan, sementara larva berumur pendek (C. 1-2 bulan), jarang dikumpulkan karena kebiasaan interstisial mereka, dan secara morfologis keras. Selain itu, tahap dewasa yang menahan musim dingin, dan bertahan dari kekeringan berkala ( Nilsson & Holmen 1995 ), membuat toleransi termal dewasa paling relevan di sini. Semua individu yang dikumpulkan adalah orang dewasa pasca-teneral awal, meminimalkan kemungkinan efek pengganggu karena variasi usia ( Bowler & Terblanche 2008 ). Semua spesies dikumpulkan sedekat mungkin dengan titik pusat rentang garis lintangnya, untuk menghindari kemungkinan efek pengganggu adaptasi lokal dalam populasi tepi rentang, dan untuk memastikan data dapat dibandingkan untuk setiap spesies (Thompson dkk. 1999). Mengingat kejadian alopatrik sebagian besar spesies, dan perbedaan posisi garis lintang dari rentang mereka, tidak mungkin untuk mengambil sampel semua taksa dari garis lintang yang sama. Data sebaran geografis spesies diambil dari Fery & Brancucci (1997) dan Fery & Hosseinie (1998). Luasan rentang lintang dihitung sebagai perbedaan (dalam derajat lintang) antara batas distribusi utara dan selatan ( Gaston 1994 ), dan titik pusat rentang lintang yang ditentukan sebagai titik tengah luas rentang lintang setiap spesies (lihat Lampiran S1, Informasi Pendukung) .

Setelah pengumpulan, individu diangkut ke laboratorium dalam wadah plastik (vol. = 1 L) yang diisi dengan vegetasi air yang lembab, disimpan dalam kantong yang diisolasi secara termal (Thermos ® , Rolling Meadows, IL, USA) untuk mengurangi variasi suhu dalam wadah. Di laboratorium, spesimen dipelihara dalam air kolam buatan yang diangin-anginkan [APW, pH 7·5, diasamkan menggunakan HCl ( ASTM 1980 )], didistribusikan di antara sejumlah akuarium (vol. = 5 L, maksimum 20 individu per akuarium) dalam a 12 : 12 jam L/D, dan diberi makan larva chironomid ad libitum. Individu diberi makan, dan dikawinkan dalam perawatan kami, menunjukkan bahwa mereka berfungsi secara normal. Akuarium disegel dengan Cling-film ® untuk mengurangi penguapan dan mencegah individu melarikan diri. Semua pekerjaan dilakukan di ruang suhu konstan yang dikendalikan komputer. Fluktuasi suhu air maksimum di antara semua akuarium selama periode aklimatisasi adalah 0·6 °C, diukur dengan termometer maksimum-minimum (Jumbo Thermometer Oregon Scientific© model EM899 ± 0·1 °C Oregon Scientific©, Portland, OR, USA) . Dalam upaya untuk menghindari kemungkinan efek pengganggu dari riwayat termal individu baru-baru ini, spesimen dipertahankan dalam kondisi yang identik dan konstan di laboratorium sebelum eksperimen (misalnya Sokolova & Pörtner 2003), yang kemungkinan akan meminimalkan efek aklimatisasi sebelumnya pada individu. Setiap spesies dibagi secara acak menjadi dua kelompok yang sama, diaklimatisasi pada 14·5 atau 20·5 °C masing-masing dan spesimen disimpan di laboratorium selama 7 hari pada dua suhu ini sebelum percobaan dilakukan (Hoffmann & Watson 1993 Klok & Chown 2003 Terblanche & Chown 2006). Suhu dipilih karena berada dalam kisaran yang dialami oleh Deronectes dewasa di lapangan (D. T. Bilton, pengamatan pribadi S. Fenoglio, A. Millán, P. Abellán & D. Sánchez-Fernández, komunikasi pribadi), dan sama untuk semua spesies yang dipelajari untuk membandingkan kemampuan aklimatisasi relatif taksa. Selama aklimatisasi, penggunaan suhu ekstrim dihindari, karena dapat berpotensi bertindak (setidaknya untuk spesies tertentu) sebagai perusak (peju) suhu (lihat Pörtner 2002 Woods & Harrison 2002), menunjukkan aklimatisasi mungkin tidak membuat stres, dan memang tidak ada kematian yang terjadi selama aklimasi. Setelah aklimasi, individu dari setiap kelompok suhu aklimatisasi selanjutnya secara serampangan ditugaskan ke dua subkelompok yang sama: digunakan untuk mengukur toleransi terhadap panas dan dingin masing-masing untuk individu dari masing-masing spesies yang disimpan pada 14·5 atau 20·5 °C.

Batas termal dan kemampuan aklimatisasi Deronectes jenis

Untuk menentukan biologi termal spesies, kami menggunakan batas termal mematikan atas dan bawah [didefinisikan sebagai batas termal atas (UTL) dan batas termal bawah (LTL) selanjutnya], karena ini membuktikan ukuran toleransi termal yang paling andal dan dapat diulang pada kumbang penyelam. Batas mematikan disukai di antara berbagai titik akhir yang dapat diidentifikasi dalam eksperimen toleransi termal, karena menunjukkan varians terendah (lihat Lutterschmidt & Hutchison 1997a,b Calosi dkk. 2008A ) namun, penggunaan titik akhir subletal (misalnya kelumpuhan) tidak mengubah hasil.

Eksperimen dimulai pada suhu di mana individu dari subkelompok tertentu telah diaklimatisasi. Tes toleransi termal bergantung pada metode dinamis, dan dilakukan di udara dalam pelat kultur plastik 24-sumur (diameter = 12 mm, kedalaman = 18 mm) generik (Corning Ltd, Sunderland, Inggris), ditempatkan di komputer yang dikendalikan penangas air (Grant LTC 6–30), dipanaskan dan didinginkan, melalui program ramping (±1 °C min -1 ) menggunakan Grant Coolwise Software [Grant Instruments (Cambridge) Ltd, Herts, UK]. Laju ramping eksperimental dan suhu ekuilibrasi dapat memengaruhi hasil uji toleransi termal ( Terblanche dkk. tahun 2007 dkk. 2009 ), dan memilih tingkat kemiringan yang relevan secara ekologis sulit dilakukan ketika data lingkungan yang komprehensif kurang. Akibatnya, kami menggunakan tingkat ramping yang identik, untuk memungkinkan perbandingan antara taksa, dan dengan penelitian sebelumnya (Lutterschmidt & Hutchison 1997a,b).

Individu diperkenalkan, satu per sumur, hingga maksimal 12 individu pada satu waktu, dengan dua peneliti bekerja sama, untuk penentuan batas toleransi termal yang akurat. Suhu aktual di dalam setiap sumur diukur secara langsung menggunakan termometer digital terkalibrasi (Omega ® HH11 Omega Engineering Inc., Stamford, CT, USA) yang dilengkapi dengan 'termokopel kawat halus presisi' Omega ® (tipe K – dia./ga. 0 · 010 Teflon). Individu dikeluarkan dari akuarium aklimasi mereka, dengan cepat tetapi hati-hati dikeringkan di atas kertas penyerap dan ditempatkan di tempat yang bersih, kering, dan baik. Untuk menghindari pelarian, pelat sumur ditutup dengan tutup plastiknya di antara penambahan individu. Setelah percobaan dimulai, tutupnya dilepas untuk memungkinkan aerasi penuh dan menghindari penumpukan uap air.

Rentang termal (TR) dihitung sebagai perbedaan antara UTL rata-rata pada 20,5 °C dan LTL pada 14,5 °C, karena ini mungkin mewakili ukuran yang paling realistis secara ekologis dari toleransi spesies terhadap suhu tinggi dan rendah ( karena mereka mengikuti suhu aklimatisasi tinggi dan rendah, masing-masing – lihat Calosi dkk. 2008B – dan, secara keseluruhan, spesies menunjukkan toleransi yang lebih tinggi terhadap panas dan dingin ketika diaklimatisasi pada suhu ini). Kemampuan aklimatisasi toleransi termal atas dan bawah (ΔUTL dan LTL) diperkirakan sebagai perbedaan mutlak antara batas termal (untuk suhu tinggi atau rendah masing-masing) diukur pada dua suhu aklimatisasi ( Stillman 2003 ). Nilai positif untuk UTL atau LTL menunjukkan kemampuan positif suatu spesies untuk meningkatkan UTL rata-rata atau LTL rata-ratanya, setelah aklimatisasi pada suhu yang lebih tinggi atau lebih rendah. Setelah percobaan, individu ditimbang (sampai ±0,001 g) menggunakan timbangan Sartorius 1204 MP2 (Sartorius Ltd, Epsom, UK).

Kemampuan penyebaran

Mendapatkan perkiraan akurat dari kemampuan penyebaran relatif spesies (DA) sulit (lihat Bilton, Freeland & Okamura 2001), karena penyebaran itu sendiri adalah sifat yang muncul, dipengaruhi oleh banyak faktor morfologi, fisiologis dan ekologis (Rundle, Bilton & Foggo 2007b). Untuk penyebar udara seperti: Deronectes spesies, bagaimanapun, ukuran sayap adalah fitur yang jelas yang telah disarankan untuk berkorelasi dengan DA relatif (misalnya Rundle et al. 2007a). Hal ini sangat mungkin berlaku dalam perbandingan taksa yang terkait erat, jika tidak serupa, dan penggunaan ukuran sayap sebagai pengganti DA relatif diadopsi di sini. Kami secara khusus menggunakan rasio panjang sayap/panjang tubuh, karena ini mungkin memberikan ukuran perbandingan yang baik dari DA relatif spesies kumbang penyelam (lihat Rundle dkk. 2007A ): kemungkinan pengganti DA lainnya (panjang sayap, rasio luas sayap/massa tubuh) juga dieksplorasi, dan memberikan hasil yang sama seperti yang disajikan di sini. Individu yang sayapnya akan diperiksa pertama kali difoto utuh di bawah stereomikroskop Leica MZ8 (x50 mag) menggunakan Nikon Coolpix 4500. Sayap kanan diambil dari 10 individu dari setiap spesies, dicerna dalam 10% kalium hidroksida selama 15 menit untuk meningkatkan fleksibilitas, sebelum dibuka dan dipasang dalam larutan asam laktat (asam DL-laktat 85% w/w sirup – Sigma Chemical Co., St Louis, MO, USA) pada slide mikroskop. Sayap yang terdisartikulasi diperiksa dan difoto seperti dijelaskan di atas, dan panjang sayap diperkirakan menggunakan UTHSCA Image Tool Versi 3.0. Panjang tubuh masing-masing individu diukur dari depan pronotum sampai ujung elytra (untuk menghindari kesalahan pengukuran akibat kontraksi kepala ke pronotum) menggunakan pendekatan fotomikroskopik yang sama.

Analisis statistik

Massa tubuh spesies berbeda secara signifikan di antara Deronectes (F13, 712 = 90·282 n = 726 P < 0,00001), dan karena itu dianggap sebagai kovariat dalam analisis selanjutnya. Jumlah individu yang diteliti berkisar antara 26 in Deronectes angusi Fery dan Brancucci ke 92 inci D. hispanikus Rosenhauer. Tidak ada korelasi signifikan yang ditemukan antara jumlah individu dari setiap spesies yang diperiksa dengan sifat fisiologis, ekologis atau biogeografis (korelasi Pearson minimum Z12 = 1·148 P = 0·251), menunjukkan bahwa perbedaan antarspesies dalam ukuran sampel tidak mempengaruhi hasil. Massa tubuh rata-rata (±SE) dan jumlah individu yang diuji untuk setiap spesies diberikan dalam Lampiran S2, Informasi Pendukung.

Perbedaan mean UTL dan mean LTL antara spesies pertama dianalisis secara terpisah menggunakan ancova , termasuk massa tubuh sebagai kovariat, sedangkan perbedaan mean DA antara spesies dianalisis menggunakan ANOVA. Kami menyelidiki faktor-faktor yang mempengaruhi variasi dalam jangkauan dan posisi garis lintang, dan batas jangkauan utara dan selatan menggunakan serangkaian model regresi berganda. Kriteria Informasi Akaike (AIC) digunakan untuk memilih model yang didukung terbaik, sebuah pendekatan yang mengurangi masalah yang terkait dengan pengujian ganda dan co-linearitas variabel penjelas (Burnham & Anderson 2002). Dalam setiap analisis, model dibangun menggunakan semua kombinasi variabel eksperimental, dan lima model terbaik disajikan dalam hasil. Model tunggal yang didukung terbaik untuk setiap analisis dipilih berdasarkan bobot AIC, yang dihitung untuk mengevaluasi kemungkinan relatif suatu model, dengan data dan model yang dipasang, diskalakan menjadi satu (Burnham & Anderson 2002). Pemilihan model dilakukan dengan menggunakan data mentah dan kontras independen ( Felsenstein 1985 ) yang diturunkan dari filogeni berbasis mtDNA ( Ribera dkk. 2001 Ribera & Vogler 2004). Kontras diproduksi menggunakan algoritma CRUNCH dari paket perangkat lunak CAIC (Purvis & Rambaut 1995), dan regresi skor kontras dipaksa melalui asal (Garland, Harvey & Ives 1992).

Batas jangkauan selatan spesies terdistribusi secara normal, sedangkan jangkauan garis lintang dan titik pusat dinormalisasi mengikuti log10 transformasi. Dalam kasus batas jangkauan utara, data dinormalisasi mengikuti log ganda10 transformasi. Normalitas dalam semua kasus dinilai melalui tes Shapiro-Wilks P > 0·05. Semua analisis statistik dilakukan dengan menggunakan JMP IN ® versi 5.1, kecuali untuk model regresi berganda, yang dijalankan dalam R v.2.5.1 ( R Development Core Team, 2007 ) dan SPSS v.15.0.


I nferensi A algoritma untuk A ncestral Species L ocations Menggunakan P hylogenetic Tree

Pertama, kami membuat beberapa notasi untuk memudahkan eksposisi. Pertimbangkan pohon filogenetik biner tetap dengan n ujung dan karenanya n 1 simpul internal yang sesuai dengan taksa leluhur seperti yang direpresentasikan dalam Gambar 3. Misalkan d ( i ) adalah nilai sifat simpul anak dari simpul internal tertentu i , dan biarkan a ( i ) menunjukkan nilai sifat dari nenek moyang i . Jika i adalah nenek moyang bersama (MRCA) terbaru dari semua taksa, misalkan a ( i ) adalah himpunan kosong . Kami mengamati domain R 1 , … , R n di ujung pohon dan kami ingin memperkirakan nilai leluhur dan suku varians di bawah proses BM bivariat dengan matriks kovarians V . Misalkan ( x ) merupakan distribusi prior untuk lokasi MRCA di pohon. Pada bagian selanjutnya, kami menyajikan algoritma MCMC untuk pengambilan sampel dari distribusi posterior bersama dari nilai simpul leluhur a dan parameter varians Brown V .

Ilustrasi dari empat kemungkinan bersyarat berbeda yang digunakan oleh pengambilan sampel MCMC dari meruntuhkan algoritma mengikuti notasi dalam teks utama. Kemungkinan bersyarat untuk BM menggunakan titik direpresentasikan sebagai f (•) sedangkan kemungkinan bersyarat yang membutuhkan integrasi pada domain terbatas diwakili oleh g (R | •). Pada setiap panel, densitas posterior sedang dievaluasi pada ancestor x (ditandai dengan titik hitam). a) Kapan x dihubungkan oleh cabang internal saja ( s , t 1 dan t 2 ) dan bukan MRCA, distribusi kondisionalnya bergantung pada titik reguler BM dengan leluhurnya A dan putri D1 dan D2. b) Kapan x terhubung dengan dua cabang terminal t 1 dan t 2 dan satu cabang internal s , distribusi bersyaratnya tergantung pada integrasi domain terbatas R 1 dan R 2 , dan BM reguler dengan leluhurnya A. c) Kapan x terhubung dengan dua cabang internal s dan t 2 dan satu cabang terminal t 1 , distribusi kondisionalnya tergantung pada integrasi domain terbatas R 1 dan proses BM reguler dengan D2 dan A. d) Kapan x adalah MRCA, distribusi kondisionalnya bergantung pada sebelumnya (x), dan proses BM reguler dengan D1 dan D2.

Ilustrasi dari empat kemungkinan bersyarat berbeda yang digunakan oleh pengambilan sampel MCMC dari meruntuhkan algoritma mengikuti notasi dalam teks utama. Kemungkinan bersyarat untuk BM yang menggunakan titik direpresentasikan sebagai f (•) sedangkan kemungkinan bersyarat yang membutuhkan integrasi pada domain terbatas diwakili oleh g (R | •). Pada setiap panel, densitas posterior dievaluasi pada ancestor x (ditandai dengan titik hitam). a) Kapan x dihubungkan oleh cabang internal saja ( s , t 1 dan t 2 ) dan bukan MRCA, distribusi kondisionalnya bergantung pada titik reguler BM dengan leluhurnya A dan putri D1 dan D2. b) Kapan x terhubung dengan dua cabang terminal t 1 dan t 2 dan satu cabang internal s , distribusi bersyaratnya tergantung pada integrasi domain terbatas R 1 dan R 2 , dan BM reguler dengan leluhurnya A. c) Kapan x terhubung dengan dua cabang internal s dan t 2 dan satu cabang terminal t 1 , distribusi kondisionalnya tergantung pada integrasi domain terbatas R 1 dan proses BM reguler dengan D2 dan A. d) Kapan x adalah MRCA, distribusi kondisionalnya bergantung pada sebelumnya (x), dan proses BM reguler dengan D1 dan D2.


Abstrak

Distribusi ukuran kisaran spesies telah menerima perhatian yang sangat sedikit dibandingkan dengan distribusi kelimpahan spesies. Namun, pengakuan akan pentingnya fenomena skala regional untuk struktur kumpulan lokal, dan munculnya 'makroekologi', mulai mengubah situasi ini. Semakin banyak penelitian menunjukkan bahwa distribusi ini, secara umum, mendekati lognormal, meskipun interpretasi rumit oleh berbagai faktor. Dengan asumsi pola distribusinya nyata, hal itu dapat dilihat dari segi determinan evolusioner dan ekologi dari kemunculan spesies, meskipun signifikansi relatifnya masih belum jelas. Bentuk sebarannya memiliki berbagai konsekuensi penting, terutama bagi inventarisasi fauna dan flora serta bagi konservasi.


Kesimpulan

Dengan menggunakan kombinasi morfologi, genetika, pemodelan ceruk ekologis dari data terkini dan paleoekologi, serta eksperimen fisiologis, kami telah merekonstruksi sejarah evolusi kompleks yang mengejutkan dari kelompok kumbang penyelam ini di Mediterania barat. NS A. brunneus kompleks beragam ca. 0,6-0,25 Ma, kemungkinan besar di selatan semenanjung Iberia setelah penjajahan A. ramblae dari Maroko utara. Sementara populasi pulau (A. ramblae di Kepulauan Balearic dan A. rufulus di Corsica dan Sardinia) tampaknya tidak membedakan secara substansial baik morfologi maupun ekologi, benua A. brunneus berevolusi morfologi yang paling khas dalam kompleks, serta toleransi yang lebih luas untuk habitat dingin, sesuatu yang tampaknya telah memfasilitasi perluasan jangkauan.

Dari distribusi potensial yang berkurang selama LIG, A. brunneus dan A. ramblae tampaknya telah memperluas jangkauan mereka selama glasial terakhir (0,03-0,01 Ma) (A. brunneus ke area yang jauh lebih luas), yang mencakup sebagian besar potensi kemarahan LGM mereka di Mediterania barat. Ekspansi ini disertai dengan ekspansi populasi, seperti yang diidentifikasi melalui model demografis. Namun, meskipun distribusi potensial saat ini jauh lebih luas, kedua spesies belum menempati area di luar distribusi potensial LGM mereka kecuali untuk beberapa populasi terisolasi dari A. brunneus di Prancis dan Inggris. Di Sardinia, Kepulauan Balearic dan mungkin Tunisia, kontak sekunder antara spesies kompleks telah mengakibatkan introgresi, dengan beberapa spesimen menunjukkan ketidaksesuaian antara haplotipe mitokondria yang khas dari A. brunneus dan urutan nuklir dan morfologi khas dari A. rufulus atau A. ramblae masing-masing.

Pekerjaan kami menyoroti dinamika kompleks spesiasi dan perluasan jangkauan dalam refugia selama siklus glasial terakhir, dan fakta bahwa biota Eropa selatan, selain menjadi sumber penjajah dari daerah yang sebelumnya mengalami glasial di utara, mengalami banyak perubahan evolusioner selama periode waktu ini. Ini juga menyoroti peran Afrika Utara yang mendasar tetapi sering diabaikan sebagai sumber keanekaragaman hayati di Eropa [70�].


Database Rentang Geografis Spesies - Biologi

Satuan Delapan. Lingkungan Hidup

Organisme hidup sebagai anggota populasi, kelompok individu yang terjadi bersama-sama pada satu tempat dan waktu. Apakah populasinya adalah sekelompok burung, serangga, tumbuhan, atau manusia, ahli ekologi dapat mempelajari beberapa elemen kunci dari populasi dan mempelajari lebih lanjut tentang mereka.

Istilah “penduduk” dapat didefinisikan secara sempit atau luas. Fleksibilitas ini memungkinkan kita untuk berbicara dalam istilah yang sama tentang populasi manusia di dunia, populasi protista dalam usus rayap individu, atau populasi rusa yang menghuni hutan. Kadang-kadang batas-batas yang mendefinisikan suatu populasi sangat tajam, seperti tepi danau pegunungan yang terisolasi untuk ikan trout, dan kadang-kadang lebih kabur, seperti ketika individu rusa dengan mudah bergerak bolak-balik di antara dua hutan yang dipisahkan oleh ladang jagung.

Lima aspek populasi sangat penting: rentang populasi, yang merupakan area di mana populasi terjadi Distribusi populasi, yang merupakan pola jarak individu dalam rentang itu Ukuran populasi, yang merupakan jumlah individu populasi berisi kepadatan populasi, yang adalah berapa banyak individu yang berbagi area dan pertumbuhan populasi, yang menggambarkan apakah suatu populasi tumbuh atau menyusut, dan pada tingkat berapa. Kami akan mempertimbangkan masing-masing secara bergantian.

Tidak ada populasi, bahkan tidak satu pun yang terdiri dari manusia, terjadi di semua habitat di seluruh dunia. Sebagian besar spesies, pada kenyataannya, memiliki rentang geografis yang relatif terbatas, dan rentang beberapa spesies sangat kecil. Pupfish Devil's Hole, misalnya, hidup di satu mata air panas di selatan Nevada, dan isopoda Socorro dikenal dari satu sistem mata air di New Mexico. Gambar 35.4 menunjukkan kumpulan spesies lain yang ditemukan dalam satu populasi di habitat yang terisolasi. Di sisi lain, beberapa spesies tersebar luas. Lumba-lumba biasa (Delphinus delphis), misalnya, ditemukan di seluruh lautan dunia.

Gambar 35.4. Spesies yang terjadi hanya di satu tempat.

Spesies ini, dan banyak lainnya, hanya ditemukan dalam satu populasi. Semuanya adalah spesies yang terancam punah, dan jika sesuatu terjadi pada habitat tunggal mereka, populasi, dan spesiesnya, akan punah.

Organisme harus beradaptasi dengan lingkungan di mana mereka terjadi. Beruang kutub beradaptasi dengan sangat baik untuk bertahan dari dinginnya Kutub Utara, tetapi Anda tidak akan menemukannya di hutan hujan tropis. Prokariota tertentu dapat hidup di perairan yang hampir mendidih di geyser Yellowstone, tetapi mereka tidak muncul di aliran yang lebih dingin di dekatnya. Setiap populasi memiliki persyaratannya sendiri—suhu, kelembapan, jenis makanan tertentu, dan sejumlah faktor lain—yang menentukan di mana ia dapat hidup dan bereproduksi dan di mana ia tidak dapat. Selain itu, di tempat-tempat yang sesuai, kehadiran predator, pesaing, atau parasit dapat mencegah suatu populasi menempati suatu area, topik yang akan kita bahas nanti dalam bab ini.

Rentang Ekspansi dan Kontraksi

Rentang populasi tidak statis, mereka berubah seiring waktu. Perubahan ini terjadi karena dua alasan. Dalam beberapa kasus, lingkungan berubah. Misalnya, ketika gletser mundur pada akhir Zaman Es terakhir, kira-kira 10.000 tahun yang lalu, banyak populasi tumbuhan dan hewan Amerika Utara meluas ke utara. Pada saat yang sama, saat iklim menghangat, spesies mengalami pergeseran ketinggian di mana mereka bisa hidup. Suhu di tempat yang lebih tinggi lebih dingin daripada di tempat yang lebih rendah. Misalnya, kisaran pohon yang bertahan lebih baik di suhu yang lebih dingin bergeser lebih jauh ke atas gunung ketika suhu meningkat di suatu daerah seperti yang ditunjukkan pada Gambar 35.5.

Gambar 35.5. Pergeseran ketinggian dalam rentang populasi di pegunungan barat daya Amerika Utara.

Selama periode glasial 15.000 tahun yang lalu, kondisinya lebih dingin daripada sekarang. Saat iklim menghangat, spesies pohon yang membutuhkan suhu lebih dingin telah menggeser jangkauannya ke atas di ketinggian sehingga mereka hidup dalam kondisi iklim di mana mereka beradaptasi.

Selain itu, populasi dapat memperluas jangkauan mereka ketika mereka dapat berpindah dari habitat yang tidak ramah ke daerah yang sebelumnya tidak berpenghuni. Misalnya, kuntul sapi asli Afrika muncul di Amerika Selatan bagian utara beberapa waktu di akhir 1800-an. Burung-burung ini melakukan penyeberangan transatlantik hampir 2.000 mil, mungkin dibantu oleh angin kencang. Sejak itu, mereka terus memperluas jangkauan mereka dan sekarang dapat ditemukan di sebagian besar Amerika Serikat (gambar 35.6).

Gambar 35.6. Perluasan jangkauan kuntul ternak.

Kuntul ternak—dinamakan demikian karena mengikuti ternak dan hewan berkuku lainnya, menangkap serangga atau vertebrata kecil yang mereka ganggu—pertama kali tiba di Amerika Selatan pada akhir 1800-an.

Sejak tahun 1930-an, perluasan jangkauan spesies ini telah didokumentasikan dengan baik, karena telah bergerak ke barat dan naik ke sebagian besar Amerika Utara, serta menuruni sisi barat Andes hingga dekat ujung selatan Amerika Selatan.

Hasil Pembelajaran Utama 35.2. Populasi adalah sekelompok individu dari spesies yang sama yang hidup bersama di suatu daerah. Jangkauannya, area yang ditempati populasi, berubah seiring waktu.

Jika Anda adalah pemegang hak cipta dari materi apa pun yang terdapat di situs kami dan berniat untuk menghapusnya, silakan hubungi administrator situs kami untuk persetujuan.


Diskusi

Metode Terbaik dan Terburuk untuk Rekonstruksi Jangkauan

Hasil dari simulasi kontraksi jarak dan kepunahan menunjukkan pola makroevolusi dan makroekologi, setidaknya di masa lalu yang relatif baru, dapat dipelajari dengan andal hanya dengan menggunakan beberapa lokasi kemunculan fosil. Rentang kontraksi di kedua bioma kering dan basah dapat dipertahankan dan dideteksi menggunakan berbagai metode paleobiologi yang umum digunakan. Dalam bioma basah, kami menemukan bahwa metode jarak lingkaran besar dan lambung cembung bekerja paling baik dan memberikan hasil yang konsisten secara statistik hanya dengan menggunakan 3+ situs. Latitudinal range also performs well above a threshold of 5+ sites, whereas alpha hull performs relatively poorly, requiring a threshold of 100+ sites.

We find that range contraction is easier to detect in dry biomes than in wet biomes, with three sites sufficient for all four methods. This result at first appears counterintuitive: more preservable area should logically produce a more reliable fossil record, and thus a more reconstructable range. However, when comparing the sizes of the two ranges, the patchiness of the preservable areas in the dry biome may allow for detection of a statistical difference between the larger and smaller range (although this may hold only when fossil “localities” are randomly distributed, as they are here). We make a preliminary attempt to test this hypothesis by sampling 0.5° by 0.5° grid cells from within each of the four ranges shown in Figure 1 (see Supplementary Figs. 6, 7), and comparing mean pairwise distances between the centroids of preservable areas within each grid cell. The results, however, reveal that mean distances are equivalent in both wet and dry biomes (see Supplementary Fig. 8), and thus patchiness in preservable areas may not be driving the observed pattern and some other explanation may be required.

Similar to the range-contraction experiments, our extinction simulations offer justification for many paleoecological and macroevolutionary studies that reconstruct paleo-range sizes and dynamics three of the four studied range-reconstruction methods (maximum great-circle distance, maximum latitudinal range, and convex hull) accurately predicted (>90% of P-values ≤ 0.05) patterns of species’ survival based on range size using only approximately 10 fossil sites in our high-sensitivity scenario. Although there were substantial differences between the low- and high-sensitivity scenarios, the results suggest site thresholds that could potentially guide future studies. That is to say, to achieve at least 90% accuracy assuming a low-sensitivity threshold, 10+ sites are needed for the convex-hull method, and 50+ sites are needed for maximum latitudinal range and maximum great-circle distance. Alpha hulls performed extremely poorly in both scenarios (see Supplementary Table 3). Although the method can perform well when sites are randomly placed anywhere within the range (e.g., see Supplementary Fig. 1), alpha shapes struggle to resolve real range geometries when clustered within linearly-oriented features such as streams, rivers, and lakes. Increasing the α value for hulls can help to reconstruct more realistic geometries, but the resulting polygons become less concave and thus equivalent to convex-hull methods.

Perhaps counterintuitively, all range-reconstruction methods performed better under the high-sensitivity (

50% extinction) scenario over the low-sensitivity (

90% extinction) scenario. One explanation for this may be a lack of statistical power, creating difficulty in recovering the correct extinction pattern under the low-sensitivity threshold. That is to say, few species “survive” in this scenario, making it difficult for the model to determine correctly the difference in range size between those species that go extinct and those that do not. Alternatively (or in addition), the better method performance in the high-sensitivity scenario may be an inadvertent result of the specific species that straddle the low- and high-sensitivity thresholds. At the low-sensitivity threshold, the methods are attempting to recover the “survival” of western species with ranges centered in more arid regions and the “extinction” of smaller-ranged species with ranges centered primarily in Florida and Louisiana. Given the limited distribution of water bodies (and therefore of preservable area) in the western United States, all methods will consistently underestimate range size of the western-distributed species. Conversely, the preservable parts of each range will more closely approximate the perimeter of species distributed in the wetter southeastern United States, and thus a random placement of sites will more closely reconstruct actual range sizes for these species. In other words, the simulations are trying to recover a result wherein a species prone to range underestimation survives and a species prone to range overestimation goes extinct. Although this arrangement of species and thresholds was entirely inadvertent, it illustrates the difficulty of determining the relative sizes of species’ ranges from fossil locality data if these species are distributed in radically different biomes.

Practical Comparisons with the Terrestrial Fossil Record

The number of localities needed for accurate paleo range-size analyses can be compared directly with the number available for various taxa in the fossil record. Such quantification provides a broad sense for how useful the fossil record is as a spatial, rather than a temporal, data set. Given that our range simulations are most applicable to terrestrial (non-volant) vertebrates, we downloaded all Cenozoic tetrapod (mammals, reptiles, and amphibians) occurrence data from the Paleobiology Database (https://paleobiodb.org details given in Supplementary Material 1). We split occurrences by North American Land Mammal Ages (NALMAs) these time bins range in duration from 226,000 years (Rancholabrean:

0.24–0.014 Ma) to 10.2 Myr (Arikareean: 30.8–20.6 Ma) and are probably among the shortest intervals for which multispecies range-size or biogeographic analyses could be undertaken on continental scales (see, e.g., Fraser et al. Reference Fraser, Hassall, Gorelick and Rybczynski 2014). Because many paleobiogeographic analyses of terrestrial faunas have been performed at the genus rather than the species level (see, e.g., Hadly et al. Reference Hadly, Spaeth and Li 2009), we calculated the number of occurrences for both genera and species. The results (Fig. 6) illustrate the percentage of species and genera within NALMAs preserved at each number of sites treated in our simulations (details for individual NALMAs given in Supplementary Fig. 9).

Figure 6 Percentage of Cenozoic fossil terrestrial tetrapod (mammal, reptile, and amphibian) species (left) and genera (right) discovered in increasing numbers of fossil sites (defined as localities with unique paleolatitude and paleolongitude coordinates) in North America. Boxes illustrate the spread of values for all North American Land Mammal Ages (NALMAs), with mean values superimposed as points (see Supplementary Fig. 6 for details of individual NALMAs). Comparing these values with the trajectory of percentage successful simulations for different range-reconstruction methods shown in Figs. 4 and 5 provides a measure of the utility of the spatial fossil record of tetrapods for analysis of range-size dynamics in deep time.

At the species level, results range from poor coverage (only 10% of species in the Rancholabrean are preserved at 3 sites, decreasing to nearly 0% for 5+ sites) to remarkably good coverage (e.g., 30% of species are preserved at 5 sites and

10% of species are preserved at 20 sites in the Wasatchian). For the vast majority of NALMAs (with the exception of the Monroecreekian and Duchesnian), between 10% and 50% of species are preserved at 3+ sites, a number that our simulations suggest is sufficient for detecting changes in range-size dynamics using great-circle distance and convex-hull methods in either wet or dry biomes. At 10+ sites (the threshold suggested for two of our methods for detecting the correct split of victims and survivors in our extinction experiment), most time bins possess between 1% to 10% of species (and

17% in the Wasatchian), which still represents an encouraging return when 100–300 species are typically recorded in each time bin. Only in the Wasatchian are any species (0.23%) preserved at 100+ sites, rendering alpha hull effectively useless for this type of analysis. The results are even more encouraging at the genus level, with 11 out of 22 NALMAs possessing 30–40% of genera represented at 5+ sites. Cumulatively, these percentages suggest that many hundreds of Cenozoic species may be sufficiently well sampled to examine changes in their distribution and geographic range size and to test a broad swath of macroecological and macroevolutionary questions. Logically, these percentages will only increase if coarser time resolution is allowed (see, e.g., Desantis et al. Reference Desantis, Tracy, Koontz, Roseberry and Velasco 2012 Darroch et al. Reference Darroch, Webb, Longrich and Belmaker 2014), although the macroecological and environmental hypotheses invoked to explain any discovered patterns will also be correspondingly broader.

Caveats and Future Directions

Our methodological framework for these simulations makes a number of assumptions, all of which introduce significant caveats to the conclusions we reach concerning the utility and completeness of the spatial fossil record. One major assumption concerns our random placement of simulated fossil sites within ranges. In reality, fossil sites are aggregated and “patchy” on all scales (Plotnick Reference Plotnick 2017), which may have a significant effect on the accuracy of range reconstruction. The other assumptions we make can be organized loosely into “top-down” (climate and tectonic activity) versus “bottom-up” (necrolysis, biostratinomy, and diagenesis) effects that control the quality of the vertebrate fossil record (Noto Reference Noto 2010). With regard to the former, although we accounted for differential preservation and incompleteness of the fossil record by varying site numbers and by restricting occurrences to preservable areas, our most influential assumption is that the entirety of a species’ range is preserved and able to be interrogated by paleontologists. However, weathering, erosion, tectonism, and isostatic/eustatic sea-level change are responsible for constantly removing or burying large quantities of fossil-bearing sedimentary rocks, such that the exposed rock area for any given geological unit typically decreases as you go further back in Earth history (Raup Reference Raup 1976 note, however, this pattern is likely more apparent for terrestrial than marine sediments, see, e.g., Peters and Heim Reference Peters and Heim 2010). Consequently, it seems likely that the accuracy of many range-size reconstruction methods will covary with the surface expression of fossiliferous sediments through time.

In terms of bottom-up effects, another assumption inherent in these simulations is that all species are equally abundant (and thus equally likely to be found as fossils) and have equivalent taphonomic potentials. With regard to the first point (rarity), the relative abundance of a species may have a huge impact on the likelihood of it being discovered as a fossil. Many authors have argued that the preservation of any one species is potentially subject to an “abundance threshold,” such that rare taxa are less likely to be preserved (and/or subsequently discovered) than common species. Modern mammalian species exhibit a bimodal pattern of rarity, with an overabundance of species in both the rarest and most common categories (Yu and Dobson Reference Yu and Dobson 2000) a large proportion of fossil tetrapod species may therefore be underrepresented in the fossil record.

With regard to the second point (taphonomy), a suite of taphonomic processes favors the preservation of some taxa over others. The most obvious of these is size—the bones of animals under 100 kg tend to weather beyond recognition more rapidly than those of larger animals (Behrensmeyer Reference Behrensmeyer 1978 Janis et al. Reference Janis, Scott and Jacobs 1998 Plotnick et al. Reference Plotnick, Smith and Lyons 2016). Thus, in general, smaller species may require more atypical environmental conditions to be reliably preserved and, correspondingly, may tend to have smaller reconstructed ranges. In addition to overall body size, the robustness of skeletal elements (Behrensmeyer et al. Reference Behrensmeyer, Stayton and Chapman 2003, Reference Behrensmeyer, Fursich, Gastaldo, Kidwell, Kosnik, Kowalewski, Plotnick, Rogers and Alroy 2005), selective scavenging (Bickart Reference Bickart 1984 Livingston Reference Livingston 1989), and ambient environmental energy at the time of deposition (i.e., a lake margin vs. a fast-flowing river Kidwell and Flessa Reference Kidwell and Flessa 1996) are all processes that favor the preservation of some species over others, and almost certainly exert a taphonomic overprint on the reconstructed ranges of terrestrial species. With that said, the USGS Waterbodies Dataset likely represents a minimum estimate for the distribution of preservable area within a species’ range. Although tetrapod remains are most often fossilized in streams, rivers, and lakes, they can also be preserved in paleosols, aeolian sands, and within overbank deposits, none of which are incorporated here. Caves and karsted environments in particular make up a significant fraction of fossil sites in the Quarternary (Jass and George Reference Jass and George 2010 Plotnick et al. Reference Plotnick, Kenig and Scott 2015 although see Noto Reference Noto 2010 for a comprehensive list of preservable terrestrial subenvironments). Our modeled preservable area should thus be seen as conservative, and the accuracy of range-size reconstructions may be considerably better than indicated by our simulations (especially in arid environments).

Another potential problem with reconstructing range sizes from fossil locality data involves the issue of postmortem transport. Many of the aquatic settings that favor fossil preservation are also characterized by ambient currents that can move vertebrate remains. Although estimates of the maximum distance skeletal remains can travel are relatively scarce, experimental work suggests bone material can move more than 10 km over approximately 10 years of continual transport without suffering levels of breakage and abrasion that might prevent them from eventually being identified (Hanson Reference Hanson 1980 Aslan and Behrensmeyer Reference Aslan and Behrensmeyer 1996). As a result, much of the terrestrial fossil record may be, to some extent, spatially averaged. In other words, fossils may have moved significant distances from their point of death, although it is not known whether material is commonly transported entirely outside the original range of the species.

We stress that although our simulations are designed to test whether chosen range-reconstruction methods can accurately capture a “snapshot” of a species’ distribution, the vast majority of the fossil record is not only spatially averaged but also time averaged, such that typical accumulations of bone material likely represent ages spanning 10 1 –10 4 years (e.g., Behrensmeyer et al. Reference Behrensmeyer, Kidwell and Gastaldo 2000). Although this property of the fossil record prevents range dynamics from realistically being investigated on timescales less than 10 5 years, time averaging can become advantageous when testing macroecological hypotheses on larger temporal scales (e.g., Darroch et al. Reference Darroch, Webb, Longrich and Belmaker 2014). The taphonomic processes leading to time averaging filter out short-term variations and high-frequency ecological variability (such as seasonal fluctuations), such that local accumulations of fossils represent long-term habitat conditions (Kowalewski et al. Reference Kowalewski, Goodfriend and Flessa 1998 Olszewski Reference Olszewski 1999 Tomašových and Kidwell Reference Tomašových and Kidwell 2010 Saupe et al. Reference Saupe, Hendricks, Portell, Dowsett, Haywood, Hunter and Lieberman 2014). With further refinement, however, our methodological approach could be modified to reproduce dynamic range shifts over a series of time steps and to combine simulated localities from each step. In this fashion, our method could be used to systematically investigate the effect of time averaging in masking (or highlighting) relative range-size changes over longer timescales.

Finally, we suggest that our simulation approach can be adapted to study range dynamics in marine taxa. The advantages of performing such analyses in the marine realm are: (1) More studies have analyzed paleo-range dynamics in the marine than the terrestrial realm (see, e.g., Payne and Finnegan Reference Payne and Finnegan 2007 Harnik et al. Reference Harnik, Simpson and Payne 2012 Saupe et al. Reference Saupe, Qiao, Hendricks, Portell, Hunter, Soberon and Lieberman 2015), and therefore simulations will have broader applicability and explanatory power. (2) In the marine realm, overall preservation potential will be higher in a greater proportion of the species’ range than it is for terrestrial species. This will likely affect the minimum number of occurrences required to accurately reconstruct ranges but will also remove some of the problems associated with the unusual geometries of terrestrial preservable areas (i.e., for alpha hulls). (3) Although preservation potential differs in marine settings, decades of research (e.g., Kidwell and Bosence Reference Kidwell and Bosence 1991 Kowalewski et al. Reference Kowalewski, Carroll, Casazza, Gupta, Hannis-Dal, Hendy, Krause, Labarbera, Lazo, Messina, Puchalski, Rothfus, Salgeback, Stempien, Terry and Tomašových 2003 Kidwell et al. Reference Kidwell, Best and Kaufman 2005 Kosnik et al. Reference Kosnik, Hua, Kaufman and Wust 2009 Darroch Reference Darroch 2012 Olszewski and Kaufman Reference Olszewski and Kaufman 2015) have worked toward calibrating the taphonomic biases associated with different taxa in many of these settings, potentially allowing taphonomic potential to be traced onto regional-scale maps of the world’s coastlines and ocean floor. (4) The number of occurrences for marine species is typically higher than it is for terrestrial species, and perhaps promises even better news for workers studying macroecological and macroevolutionary patterns in range-size dynamics through deep time.


The Center for Tree Science at the Morton Arboretum provided financial support for the lead author. Funding for various phases of the work was provided by the Smithsonian Institution and the National Science Foundation (US).

Afiliasi

Morton Arboretum, 4100 Illinois Rte. 53, Lisle, 60532, IL, USA

Smithsonian Tropical Research Institute, Panama City, Panama

Salomón Aguilar & Rolando Pérez

Anda juga dapat mencari penulis ini di PubMed Google Cendekia

Anda juga dapat mencari penulis ini di PubMed Google Cendekia

Anda juga dapat mencari penulis ini di PubMed Google Cendekia

Kontribusi

RC directed plot censuses and inventories, assembled and analyzed the data, and wrote the paper RP and SA did field work identifying and collecting species and supervising plot censuses, and they commented on the manuscript. The author(s) read and approved the final manuscript.

Penulis yang sesuai